據周一出版的雜志報道，微軟聲稱，開源免費軟件侵犯了其235項專利。

　　在財富雜志的采訪中，微軟首席律師稱Linux的內核侵犯了微軟的42項專利，而用戶界面和其它設計方面也有65項侵權。OpenOffice.org也被指控侵犯45項專利，還有83項是針對其它免費開源軟件。

　　目前還不是很清楚微軟會如何處理這些專利問題，但微軟已經鼓勵那些依賴于Linux的大型技術公司簽署專利協議。微軟引用了在最近與三星和富士施樂的專利交換交易中Linux保護起到不少作用的例子。

　　開源軟件在計算機領域扎根非常深，對開源王國采取直接的法律行動對微軟來說并非好事。很多客戶都廣泛的采用開源軟件，并且很多如IBM、戴爾、SUN、HP、摩托羅拉和Oracle等巨頭都直接支持Linux。

　　其實開源專利問題也不是第一次引起人們的關注了。在2004年由銷售針對使用開源軟件保險的Open Source Risk Management公司進行的研究顯示，Linux有可能侵犯了至少283項專利，其中屬于微軟的專利有27項。

　　專利與開源運動尷尬的相處多年。專利為所有者帶來財富，而開源項目則是源于免費共享的理念。比較新的授權協議有時通過要求開源項目的貢獻者保證用戶和開發人員對軟件有永久和無任何專利問題的使用權來避免專利糾紛。

　　不同公司對待開源專利問題的方式也不同。例如，HP采取的是親專利（pro-patent）政策，而IBM、諾基亞、SUN等其它公司則允許開源軟件使用其部分專利。